Výklad:
  
   Modrá a stříbrná jsou barvy ze znaku majitelů Šeberova, Šviků z Lukonos, za nichž došlo ke zvelebení obce a počátkem 17. století vyrostla v Šeberově nová tvrz-dnešní dvůr.
   Dnes symbolizuje stříbrná a modrá barva dobré klima městské části a četné rybníky, které jsou pro ni charakteristické.

   Berla otočená vlevo náležela opatům. Připomíná tak nejstarší památku městské části a doklad její dávné historie - starobylý hrnčířský kostelík, zasvěcený sázavskému opatovi Prokopovi, současně je symbolemdávných vrchností - zderazských jeruzalémských rytířů u Šeberova a zbraslavských cisterciáků u Hrnčířů.

   Motiv jetelového lístu a čtyřlístku ve výzdobě středověké berly připomíná zachovanou flóru městské části, která umožnila zřízení přírodního parku Hrnčířsko - Šeberovské louky.

Popis a výklad praporu:

List praporu je dělený po délce na tři pole, horní a dolní modré barvy, prostřední bílé barvy. Barvy a rozměry praporu jsou odvozeny ze znaku městské části.